基因组的黑暗区域可能会推动新物种的进化

基因组的黑暗区域可能会推动新物种的进化

新的研究发现,遗传“暗物质”可能会推动新物种的出现。

根据这项研究,这些长的、重复的基因组片段,称为卫星DNA,最终可能会通过扰乱杂交婴儿的染色体来阻止不相容的动物交配。如果来自不同种群的动物不能交配,它们就会随着时间的推移而分化,导致物种形成。

在人类基因组的 30 亿个字母或核苷酸中,只有 1%的蛋白质可以决定眼睛颜色和身高等特征。其他 DNA 片段可能会告诉身体要制造多少蛋白质副本,或者打开或关闭不同组织中的基因,以及其他功能。然而,研究合著者、苏黎世联邦理工学院助理教授 Madhav Jagannathan 表示,近 10% 的人类基因组由重复的卫星 DNA 片段组成,多年来,科学家们认为这些片段没有任何作用。瑞士生物化学研究所。

“卫星 DNA 重复在物种中非常丰富,并在真核生物中广泛观察到,”或具有细胞核的生命形式,Jagannathan 在一封电子邮件中告诉 Live Science。“尽管如此,它们在很大程度上被认为是垃圾 DNA。”

然而,在2018 年的一项研究中,当时在麻省理工学院 (MIT) 的 Jagannathan 和他的前博士后顾问、同样在麻省理工学院的生物学家 Yukiko Yamashita 发现,其中一些 DNA 起到了关键作用:它组织 DNA在细胞核内。该研究发现,某些蛋白质会抓住 DNA 分子并将它们排列成密集的染色体束,称为染色体中心。他们发现,卫星 DNA 会告诉这些抢手的蛋白质如何捆绑和组织染色体。

在 7 月 24 日发表在《分子生物学与进化》杂志上的最新研究中,Jagannathan 和 Yamashita 发现了卫星 DNA 的另一个作用:推动物种形成。该团队正在调查果蝇物种Drosophila melanogaster 的生育能力。当研究人员删除了一种编码蛋白质 prod 的基因时,该基因与卫星 DNA 结合形成色心,果蝇的染色体分散在细胞核外。如果没有正确组织染色体的能力,果蝇就会死亡。

Jagannathan 说,这很有趣,因为删除的蛋白质是黑腹果蝇独有的。这意味着这些快速进化的卫星 DNA 序列也必须具有与它们结合的快速进化的蛋白质。

为了验证这个想法,Jagannathan 将D. melanogaster雌性与不同物种Drosophila simulans 的雄性进行了繁殖。不出所料,这些混血儿的寿命不长。当研究人员观察果蝇的细胞时,他们看到畸形的细胞核,DNA 散布在整个细胞中,就像他们在之前的实验中删除 prod 蛋白时一样。

那么为什么这意味着卫星 DNA 可以推动物种形成?研究小组怀疑,如果卫星 DNA 进化得很快,并且两种生物产生不同的卫星 DNA 结合蛋白,它们就不会产生健康的后代。由于染色体中心结合蛋白和卫星 DNA 片段在不同的种群或物种中进化不同,这种不相容性可能会很快出现。

为了验证这一假设,他们突变了导致父母双方不相容的卫星 DNA 结合基因。当他们重写果蝇的基因组以使其兼容时,他们产生了健康的杂交种。

Jagannathan 怀疑,这种卫星 DNA 的分歧可能是新物种进化的一个重要因素。他希望进一步的研究可以测试他们与其他物种不相容的杂交模型。最终,这项研究可能会为科学家找到一种方法来拯救“注定”的杂交种,或出生后无法存活很长时间的杂交种。这可以为使用杂交作为拯救极度濒危物种的方法铺平道路,例如只有两只雌性存活的北白犀牛。

最终,新研究证实了 Jagannathan 的预感,即卫星 DNA 是有目的的。

“我认为进化不可能如此浪费,”Jagannathan 说。

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